По решению Правления в 2003 году в ОАО "Оргэнергогаз" была внедрена Система менеджмента качества, соответствующая требованиям стандарта ГОСТ Р ИСО 9001-2001 (ИСО 9001:2000) и распространяющаяся на все виды деятельности Общества. Орган по сертификации систем качества ВНИИС по результатам проведения сертификационного аудита 09 сентября 2003 года выдал Обществу сертификат соответствия № РОСС RU. ИС11.К00094.

В 2005 и 2008 годах были проведены ресертификации системы менеджмента качества ОАО "Оргэнергогаз" и получены сертификаты соответствия.

В 2006 году для выполнения пусконаладочных работ и диагностики бурового и вспомогательного оборудования морских плавучих буровых установок было получено свидетельство о признании ОАО "Оргэнергогаз" Российским морским регистром судоходства.

В настоящее время проводится подготовка к сертификации системы менеджмента качества ОАО "Оргэнергогаз" на соответствие требованиям СТО Газпром 9001-2006 (разрабатываются необходимые документы, проводится обучение сотрудников), что является значительным шагом в развитии системы менеджмента качества Общества, так как требования СТО Газпром 9001-2006 гораздо более жесткие, чем ГОСТ Р ИСО 9001.

ОАО "Оргэнергогаз" первым из дочерних компаний ОАО "Газпром" cтал обладателем международного сертификата ISO 9001, выданного Швейцарским Институтом Стандартов (SGS).